Dışkı pH'ı normalde nötr veya hafif alkalidir (6.8 - 7.5). Sadece yenidoğanda fizyolojik olan daha asidik dışkılar, bağırsak enfeksiyonlarını (Escherichia coli, Rotavirus) veya laktoz veya yağ intoleransı (pankreatik yetmezlik veya safra stazına bağlı steatore) gibi sindirim bozukluklarını gösterebilir.
Dışkı pH'ı deneğin beslenme alışkanlıklarından etkilenir; örneğin et ve süt ürünlerinden aşırı derecede zengin diyetler dışkıyı daha alkali hale getirir. Aslında, çürütücü bağırsak bakteri florası, absorpsiyondan kaçan amino asitleri yok ederek toksik ve kötü kokulu aminler üretir; sonuç olarak, artan amonyak üretiminin bir sonucu olarak dışkı pH'ı yükselme eğilimindedir. Bu nedenle, kısa zincirli yağ asitlerinde (bkz. bütirat) bir azalmanın eşlik ettiği çok alkali olan bir dışkı pH'ının artan kolorektal kanser riski ile bağlantılı olması tesadüf değildir.
Dışkı pH'ı putrefaktif disbiyoz varlığında yükselme eğilimindeyse, nedenleri aşırı karbonhidrat alımında veya karbonhidratların kötü emiliminde bulunan fermentatif dysbiosis varlığında düşme eğilimindedir ( çölyak hastalığı). Bol lipid alımı, vejetaryen diyetler ve uzun süreli açlık durumunda bile dışkı pH'ı asidik hale gelir.
Test sonuçlarının bozulmasını önlemek için, dışkı idrarla kontamine olmamalı ve üriner amonyak ve paslandırıcı bakterilerin dışkı pH'ını alkali hale getirmesini önlemek için hızla soğutulmalıdır.