Sıradan amino asitler ve protein sentezi
Canlı organizmaların protein yapılarında en sık görülen amino asitlere sıradan veya proteinojenik amino asitler denir. Doğada 500'den fazla amino asit türü bilinmesine rağmen, sıradan dediğimiz sadece yirmi tane var. Bunların yanı sıra, genellikle sıradan olanların protein zincirine dahil edildikten sonra metabolizmalarından kaynaklanan, ara sıra olanlar olarak adlandırılan daha nadir olanlar da vardır. Kollajende, örneğin, iki sıradan amino asit olan lizin ve prolin, hidroksillenmiş formda (hidroksiprolin ve hidroksilisin) bulunur.
Sıradan olmayan diğer amino asitlerin çoğu, esas olarak, protein yapısındaki enzimlerin ve hormonların veya daha doğrusu peptitlerin yapısında yer alır (bu şekilde düşünülmesi için bir proteinin 100'den fazla amino asitten oluşması gerektiğini unutmayın. sırasıyla bir oligo ve bir polipeptit oluşturmak 2 ila 9 ve 10 ila 100 yeterlidir).
20 sıradan amino asit arasında hatırlanır
Alanin, Arginin, Asparagin, Aspartik Asit, Sistein, Glisin, Glutamik Asit, Glutamin, Histidin, İzolösin, Lösin, Lizin, Metiyonin, Fenilalanin, Prolin, Serin, Treonin, Triptofan, Tirozin, Valin
Sıradan olmayan amino asitlerin örnekleri şunlardır:
karnitin (uzun zincirli yağ asitlerinin enerji üretmek için kullanıldığı mitokondri içinde taşınmasında yer alır);
ornitin, sitrülin ve homosistein (amino asitlerin metabolizmasına katılın - üre döngüsü);
hidroksiprolin ve hidroksilisin (kollajen ve bazı proteinlerin bileşiminin bir parçasıdır);
sarkosin (veya metilglisin).
Bazı amino asitler ayrıca ticari veya farmakolojik öneme sahip olabilir.
- Sodyum glutamat, gıda endüstrisinde bir lezzet arttırıcı olarak kullanılır (bkz. bulyon küpü).
- L-dihidroksifenilalanin (L-DOPA), Parkinson hastalığının tedavisinde kullanılan bir ilaçtır.
- 5-hidroksitriptofan (5-HTP), fenilketonüri (belirli enzimatik eksiklikler nedeniyle esansiyel bir amino asit olan fenilalanin kullanımını engelleyen kalıtsal bir metabolik hastalık; dokularda fenilalanin birikimi) ile ilişkili nörolojik semptomların tedavisinde kullanılmıştır. ciddi cilt ve nörolojik hasardan sorumludur).
Bitkiler ve bakteriler, nisin ve alameticin gibi peptit antibiyotiklerde bulunabilen belirli amino asitleri üretebilir.
Gerekli amino asitler
20 sıradan amino asitten bazıları, vücut tarafından diğer bileşiklerden sentezlenemedikleri ve yiyeceklerle alınmaları gerektiği için esansiyel olarak adlandırılır.
İnsanlar için bunlar fenilalanin, lösin, izolösin, lisin, metionin, treonin, triptofan, valin ve çocuklarda histidin ve arginindir.
Sıradan amino asitler, kimyasal özellikler
R radikalinin (çok uzun olmayan bir zincir oluşturan atom grubu) kimyasal özelliklerine göre amino asitler çeşitli kategorilere ayrılabilir.
Apolar R'li amino asitler (hidrojen bağları oluşturamayan):
alifatik zincirli: alanin, lösin, izolösin, valin, prolin
aromatik zincirli: fenilalanin, triptofan
bir kükürt atomu içeren bir zincirle: metiyonin
Polar R ile amino asitler:
OH grubu ile: serin, treonin, tirozin
SH grubu ile: sistein
CO-NH2 grubu ile: asparagin, glutamin
H ile: glisin (kiral olmayan tek amino asit)
Bazik R ile amino asitler:
lisin, arginin, histidin
Asit R ile amino asitler:
glutamik asit, aspartik asit